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La Xunta de Galicia tiene sus orígenes en la Junta del Reino de Galicia creada en 1528 y que perviviría, con algunas interrupciones, hasta 1833.

Durante la Guerra de la Independencia Española, en 1808, se crea la Junta Suprema de Galicia para dirigir la lucha contra los franceses y mantener el orden público. La Junta Suprema asumió funciones militares, legislativas y de relaciones internacionales hasta la creación de la Junta Central española.

En 1843 se constituyó una Junta Central de Galicia presidida por Xosé Maria Suances opuesta a la regencia de Espartero.

En 1846 se produce el levantamiento del comandante Solís en Lugo, que disuelve el Consejo Provincial y la Diputación organizando la Junta Superior del Gobierno de Galicia, presidida por Pío Rodríguez Terrazo.

Finalmente, el Real Decreto-Ley 7/1978 y el Real Decreto 474/1978 aprobados el 16 de marzo de 1978 establecen la Junta de Galicia como gobierno gallego.

El Presidente de la Junta de Galicia actualmente es escogido por el Parlamento de Galicia de entre sus diputados y nombrado por el Rey. El Presidente es la más alta representación de la Junta de Galicia y es el representante de la administración estatal en Galicia. Su nombre oficial es Excelentísimo Presidente de la Junta de Galicia (en gallego Excelentísimo Presidente da Xunta de Galicia).

Los presidentes de la Junta de Galicia desde su creación son: